劳动合同和工资标准规定的问题

一、问题详情：
1、劳动合同中劳动报酬的规定是：经甲乙双方协商一致，乙方的工资报酬按下列第2款确定：
第2款：甲方实行计件工资制，具体详见甲方依法制定的劳动定额及工价标准。
我单位对给验厂老师的提供的验厂工资是按计时工资制计算的，这导致了两个地方不一致。
2、我单位与员工签订的“关于工资标准的规定----荣顺字第05号”中规定：企业职工实行月基本工资+加班工资+超产奖+考勤奖进行核算发放；管理热暖工资按基本工资+加班工资+补贴+考勤奖进行发放。而我单位的验厂工资是按基本工资+加班工资进行核算的。这导致了两个地方的工资核算方式不一致，且注明的月标准工资也不一致。
3、我财务部门早已经更改了“关于工资标准的规定----荣顺字第05号”的内容，现规定：企业职工实行月基本工资+加班工资进行核算发放;管理人员按月基本工资+加班工资进行发放。这与验厂工资的核算方式相一致，且注明的月基本给你工资也相一致。但这份新的工资标准规定却没有及时替换掉员工档案中旧的那份规定。
二、问题分析：
1、因为签订的合同是根据实际情况签订的，车间的员工的确是按计件工资制核算工资的。但是验厂需要的确是按计时工资制核算工资的合同，没有为验厂而准备与验厂工资核算方式相一致的劳动合同。
2、员工签名的关于工资标准的规定上注明的工资是按基本工资+加班工资+补贴+考勤奖核算是真实，但是这确是与验厂工资的计算方法不一致的，没有及时更换与验厂工资核算方式相一致的光子表现混新规定。
3、没有及时更新关于工资标准的规定，没有及时将新规定在全厂进行推广。
三、后果：
员工的劳动合同、关于工资标准的规定的工资核算方式与验厂工资的核算方式不一致，不统一，这直接导致了我单位的验厂不通过，这将会为企业造成严重的后果。
四、建议：
1、准备好验厂用的、与验厂工资核算方式相统一的劳动合同，让保卫科拿给每位员工重新签名和盖章。
2、及时更换出员工档案中旧的关于工资标准的规定，并让保卫科拿给每位员工签名和盖章。
3、以后有资料更新要及时更换，不要再出现拖拉现象。